重庆九州通医药有限公司是由九州通医药集团股份有限公司（股票简称：九州通，证券代码：600998）投资设立的一家医药商业、医药物流企业，成立于2005年11月2日，注册资金12000万元，位于重庆市南岸区长江工业园江桥路2号。
公司占地面积95亩，总建筑面积30000㎡，其中仓储面积24000㎡，立体库100000m3，冷库594㎡，独立的二类***库和麻醉品库42㎡，配套设施面积1200㎡；拥有各类设备设施500多台套，物流配送车辆47台。2016年公司总资产达10.65亿元，全年实现营业收入30亿元，利润4768万元，上缴税金3400万元，就业人员达500余人。
公司经营业务范围涵盖中药、西药、化学药和医疗器械批发，医药电子商务，医药物流仓储及配送服务。经营品种品规达 6800 个，上游供货商 1100 家，下游客户6000家，取得了国内 200 多种药品的全国或区域总经销或总代理资格，保障了客户多样化的需求，满足“一站式”的采购体验。
公司是九州通集团在西南地区重点布局的医药物流中心。下设子公司九州通医药集团重庆万州有限公司。凭借九州通集团先进的信息管理系统、电子商务平台、仓储物流管理系统和运输设备，以药品批发、零售连锁、医院配送及医药电子商务为核心业务，搭建了完善的营销配送网络，可支持物流中心达到年40亿元的销售规模，出库准确率可达到99.99%。同时，公司与全国3100余家药品生产企业提供药品供应链服务，为西南地区7000余家药品经营企业、医院、药店及基层医疗机构提供药品配送服务，营销网络覆盖重庆全市及云南、贵州等周边地区。公司实行全天候的物流配送服务，实现重庆市主城区12小时、200公里内24小时、200公里外2天送达，为客户提供“准确、安全、快捷”的药品配送服务。
近年来，公司致力于大力发展医院业务，有近40余人的医院业务团队，拥有医院客户600余家，其中二甲医院100余家、三甲医院20余家、基层医疗机构400余家，与重庆市90%三甲医院已开展业务合作。
经过数十年经营，公司的业绩和管理水平获得了社会的认可，公司先后获得“重庆市守合同重信用单位、南岸区重点商贸企业、南岸区优秀民营企业、安全生产标准化企业、南岸区药品安全示范批发企业”等荣誉称号。