公司前身为国营南京制药厂，成立于1935年，1992年被国务院确定为大型企业，是国家制药工业重点单位之一，2000年由深圳市安远投资集团有限公司资产重组，改制为南京制药厂有限公司，是集研发、生产和销售原料药、制剂和医药中间体为一体的大型医药企业。改制后全面实施企业战略性调整，产品结构调整，整合资产资源，引入新机制、新思路，秉承“关爱生命、再造健康”的理念，坚持“改革创新”的发展思路，不断为提高人类的生活质量和健康水平做出更大贡献。
原料药生产基地位于南京化学工业园，有六个专用及多品种生产车间，多次通过国家和国际官方GMP验收。近二十个品种销往国内和国际市场。
制剂生产基地位于南京新港经济技术开发区，有抗肿瘤药为主的粉水针注射剂的针剂车间和片剂、胶囊、颗粒剂的固体制剂车间。多次通过国家GMP验收，二十多个品种销往全国各地。
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