南京医药股份有限公司成立于1951年，1996年在上海证券交易所上市，是中国医药流通行业较早上市公司，现已发展成为跨地区、网络型的集团化企业。2014年末，公司引入境外战略投资者，积极探索混合所有制改革。公司现注册资本约13.10亿元，国资控股股东为中国500强企业南京新工投资集团有限责任公司（持股44.13%）；外资股东为世界500强Walgreens Boots Alliance（沃博联）下属子公司Alliance Healthcare Asia Pacific Limited（持股11.03%）。
公司立足于大健康产业发展，以医药批发及医药零售为主营业务，是中国医药流通行业内的区域性医药商业龙头企业。公司现有90余家分子企业，市场网络覆盖江苏、安徽、湖北、福建等地及西南区域的昆明市（在江苏、安徽、湖北、福建四省市场占有率位居前列），业务覆盖近70个城市，在区域市场积累了丰富的医药商业运作经验、资源和品牌知名度。年营业收入超500亿元，总资产超330亿元，居国内医药流通行业规模排名第六位，居2023年《财富》中国上市公司500强第257位。
公司曾荣获“全国医药流通创新示范企业”称号，是第一批“全国供应链创新与应用示范企业”；荣获江苏省“五一”劳动奖状；是南京市新医药与生命健康产业链链主企业之一，以及南京市流通领域医药现代供应链体系项目示范企业，获评南京市市级综合型总部企业。